河南中医药大学马克思主义学院是直属学校领导并独立设置的二级教学机构，是学校思想政治理论课教学管理部门和哲学社会科学理论研究机构。2017年由思政部更名为马克思主义学院，2023年入选首批河南省高校示范性马克思主义学院。

马克思主义学院现有马克思主义理论一级学科硕士学位授权点，下设马克思主义基本原理、马克思主义中国化研究、思想政治教育、中国近现代史基本问题研究等四个二级学科硕士点。学院设有马克思主义基本原理、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论、思想道德与法治、中国近现代史纲要、形势与政策、习近平新时代中国特色社会主义思想概论、研究生思政课等7个教研室。学院负责管理的中医药与经济社会发展研究中心是首批河南省特色智库建设单位。

学院现有专任教师77人，其中高级职称占比30％；担任河南省高校第二届思政课教指委“研究生思政课”分教指委副主任、河南省大中小学思政一体化建设指导委员会成员以及教学名师多人，并获批“河南省高校思政课名师工作室”。

自成立以来，马克思主义学院学科建设及各项工作成效显著。思想政治教育学科被评为河南省第八批重点学科，马克思主义理论学科评为河南省第九批重点学科校级培育学科，中医哲学为校级重点学科。近年立项国家社科基金、教育部人文社科专项课题等项目10余项，承担河南省省部级课题30余项、获得省级科研奖励30余项。发表高水平论文100余篇，出版专著、教材40余部。马克思主义学院党委被中共河南省委教育工委授予“先进基层党组织”，马克思主义中国化研究党支部被教育部授予首批“全国党建工作样板支部”培育创建单位。“初心”学习社被中共河南省委宣传部授予“河南省优秀青年马克思主义社团”，被中共河南省委教育工委、河南省教育厅授予“全省高校思想政治工作优秀品牌”荣誉称号。

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